Portugalia została uznana za niepodległe państwo przez Stolicę Apostolską w XII wieku na mocy Bulli Manifestis Probatum papieża Aleksandra III. W 1276 roku Portugalczyk Pedro Hispano został wybrany na Tron Piotrowy i przyjął imię Jan XXI.
Stosunki między Portugalią a Stolicą Apostolską osiągnęły swój szczyt dzięki nieocenionemu wkładowi korony portugalskiej i misjonarzy w ewangelizację narodów Afryki, Ameryki i Azji w kolejnych stuleciach.
Kościół św. Antoniego na Polu Marsowym (wł. Sant'Antonio dei Portugalski), poświęcony Świętemu urodzonemu w Lizbonie w 1195 r., a zmarłemu w Padwie w 1231 r., powstał z inicjatywy Guiomara z Lizbony (1363) i Kapituły Katedry w Lizbonie w celu wsparcia Pielgrzymów przybywających z Luzytanii. W 1440 roku kardynał Antão Martins de Chaves, archiprezbiter Bazyliki Św. Jana na Lateranie, za zgodą papieża Pawła II, założył Hospicjum Narodu Portugalskiego i Kościół na Polu Marsowym. W XVII wieku kościół ten został przebudowany w stylu barokowym.