圣依西多禄学院是罗马最古老的爱尔兰学院,由路加·沃丁修士(1588-1657年)于1625年创建。沃丁原籍沃特福德,1602年父母双亡后离开爱尔兰前往里斯本,1604年加入方济会。1618年12月,他作为费利佩三世派往教宗保禄五世的西班牙代表团的神学顾问来到罗马。然而,教宗拒绝了西班牙国王提出的庄严界定圣母无染原罪始胎教义的要求。尽管代表团失败了,沃丁还是在罗马度过了余生。1625年,他提出接管圣依西多禄修道院,这是一所被遗弃的西班牙小修道院,尚未完工,而且债台高筑,他希望将其改造成一所培养爱尔兰年轻方济会士的学院。事实上,由于爱尔兰本地的众多修道院在伊丽莎白时代的征服中被毁,这种修士培养在爱尔兰已不再可能。在富有的资助者的帮助下,沃丁在五年内还清了债务,完成了未完工的教堂,并大大扩建了原来的修道院。
圣依西多禄因其图书馆和档案馆而闻名于世。沃丁在研究方济会历史时亲自收集整理了图书馆和档案。时至今日,它仍然是研究方济会早期历史的学者们不可或缺的参考资料。在他的朋友、著名艺术史学家吉安·彼得罗·贝洛里(Gian Pietro Bellori,1613-1696年)的鼓励下,沃丁聘请了卡洛·马拉蒂(Carlo Maratti,1625-1713年)等才华横溢的艺术家来装饰教堂。大厅里的华丽壁画是由科莫的埃马努埃莱修士(1625-1713年)于1671/2年绘制的,以纪念爱尔兰方济各会对圣母无染原罪始胎教义的发展所做的贡献。