Das Kolleg S. Isidoro, die älteste irische Institution in Rom, wurde im Jahr 1625 von Bruder Luca Wadding (1588-1657) gegründet. Wadding, der aus Waterford stammte, verließ Irland nach dem Tod seiner Eltern 1602 und schloss sich 1604 den Franziskanern in Lissabon an. Im Dezember 1618 kam er als theologischer Berater einer spanischen Delegation, die von Philipp III. zu Papst Paul V. entsandt worden war, nach Rom. Der Papst lehnte jedoch die Bitte des spanischen Königs um eine feierliche Definition der Lehre von der Unbefleckten Empfängnis ab. Trotz des Scheiterns der Delegation blieb Wadding den Rest seines Lebens in Rom.
1625 bot er an, das kleine, unvollendete und verschuldete spanische Kloster S. Isidoro zu übernehmen und es in ein Kolleg zur Ausbildung junger irischer Franziskaner zu verwandeln. Eine solche Ausbildung war in Irland nicht mehr möglich, da die Klöster während der elisabethanischen Eroberung zerstört worden waren. Innerhalb von fünf Jahren gelang es Wadding mit Hilfe wohlhabender Gönner, die Schulden zu begleichen, die unvollendete Kirche fertigzustellen und das ursprüngliche Kloster erheblich zu erweitern.
S. Isidoro ist berühmt für seine Bibliothek und das Archiv, die von Wadding selbst aufgebaut wurden, als er an der Geschichte des Franziskanerordens arbeitete. Bis heute bleibt es eine unverzichtbare Anlaufstelle für Forscher der frühen Franziskanergeschichte. Ermutigt von seinem Freund, dem bekannten Kunsthistoriker Gian Pietro Bellori (1613-1696), beauftragte Wadding talentierte Künstler wie Carlo Maratti (1625-1713) mit der Verschönerung der Kirche. Die prächtigen Fresken im Saal, die 1671/72 von Bruder Emanuele da Como (1625-1713) gemalt wurden, würdigen den Beitrag der irischen Franziskaner zur Entwicklung der Lehre von der Unbefleckten Empfängnis.
