Obecny kościół pochodzi z 1578 roku, kiedy to polski kardynał Stanisław Hozjusz wybudował go i poświęcił patronowi Polaków, św. Stanisławowi Szczepanowskiemu, zastępując nim istniejącą wcześniej, średniowieczną budowlę Św. Salwatora in pensilis de Sorraca.
Obiekt wyposażono również w hospicjum i szpital dla rodaków pielgrzymujących do Rzymu. Przez długi czas kompleks pozostawał nieużywany. Został całkowicie odbudowany dopiero w 1735 roku. Do dziś jest Kościołem Narodowym Polonii w Rzymie.
