بعد مرسوم ميلانو في العام 313، الَّذي حصل من خلاله المسيحيون على حريّة العبادة، قرّر الإمبراطور قسطنطين التبرّع باثنتين من البازيليكات للكنيسة حديثة الولادة، المقامة على ضريح القديسين بطرس وبولس.
في وقت لاحق، في القرن الخامس، نظرًا للتّدفق المستمر للحجاج إلى القبر والأبعاد المحدودة للمبنى الأصلي لكنيسة القديس بولس، أُجبر الأباطرة الثلاثة الرئيسيين، ثيودوسيوس وفالنتينيانوس الثاني وأركاديوس (Teodosio, Valentiniano II e Arcadio)، على بناء مبنى أكبر، عُكِسَ اتجاهه نحو الغرب.
أخيرًا، فقط في العام 1854، دشّن البابا بيوس التاسع الكنيسة الحالية والضخمة التي لا تزال تحتفظ بداخلها، وفقًا للتقاليد، بالسلسلة التي ربطت الرسول بولس بالجندي الروماني أثناء مراقبته بانتظار المحاكمة.
